Самый простой способ проверить целостность контейнера MKV – натравить на него небольшую бесплатную утилитку MatroskaDiag, которая входит в состав Matroska Pack (www.free-codecs.com/download/Matroska_Pack.htm). Если не хотите ставить весь пакет, поищите эту программку в Сети – она представляет собой один-единственный исполняемый файл, не требующий установки.
Столкнувшись как-то с аналогичной проблемой, я выяснил, что подвисания могут происходить и по вине самого плеера – похоже, некоторые из проигрывателей просто не справляются со скачками битрейта во время раскодирования видео высокого разрешения. Путем долгих экспериментов было установлено, что меньше всего проблем с воспроизведением HDV у MPlayer (www.mplayerhq.hu) – так что имеет смысл попробовать именно его. Если же вам не по душе аскетичный интерфейс MPlayer, для этого проигрывателя существует отличная графическая оболочка под названием SMPlayer (smplayer.sourceforge.net).